Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc42Q5SV66 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms