Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tns3Q5SSZ5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tns3Q5SSZ5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms