Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms