Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5431Q5NCB3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5431Q5NCB3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms