Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clhc1Q5M6W3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clhc1Q5M6W3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms