Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1lQ5D525 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms