Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trp53i11Q4QQM4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trp53i11Q4QQM4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms