Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shank3Q4ACU6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shank3Q4ACU6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shank3Q4ACU6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Shank3Q4ACU6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Shank3Q4ACU6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Shank3Q4ACU6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Shank3Q4ACU6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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