Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms