Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smim9Q3V0X1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim9Q3V0X1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim9Q3V0X1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim9Q3V0X1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim9Q3V0X1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim9Q3V0X1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim9Q3V0X1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim9Q3V0X1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim9Q3V0X1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim9Q3V0X1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim9Q3V0X1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim9Q3V0X1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim9Q3V0X1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim9Q3V0X1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim9Q3V0X1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim9Q3V0X1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim9Q3V0X1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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