Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930567H17RikQ3V0K5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930567H17RikQ3V0K5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930567H17RikQ3V0K5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930567H17RikQ3V0K5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930567H17RikQ3V0K5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930567H17RikQ3V0K5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930567H17RikQ3V0K5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930567H17RikQ3V0K5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms