Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Garnl3Q3V0G7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms