Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms