Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thsd4Q3UTY6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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