Protein–RNA interactions for Protein: Q3URF8

Kctd21, BTB/POZ domain-containing protein KCTD21, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd21Q3URF8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kctd21Q3URF8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms