Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shisa3Q3UPR0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms