Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ell2Q3UKU1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ell2Q3UKU1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms