Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trafd1Q3UDK1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms