Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip13Q3UA06 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms