Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssbp4Q3U4B1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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