Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms