Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ulk3Q3U3Q1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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