Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rnf149Q3U2C5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rnf149Q3U2C5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnf149Q3U2C5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnf149Q3U2C5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnf149Q3U2C5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rnf149Q3U2C5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rnf149Q3U2C5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rnf149Q3U2C5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rnf149Q3U2C5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rnf149Q3U2C5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Rnf149Q3U2C5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Rnf149Q3U2C5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Rnf149Q3U2C5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf149Q3U2C5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf149Q3U2C5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf149Q3U2C5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf149Q3U2C5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf149Q3U2C5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf149Q3U2C5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Rnf149Q3U2C5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf149Q3U2C5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf149Q3U2C5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf149Q3U2C5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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