Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm21440Q3TTD8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm21440Q3TTD8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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