Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gtf3c3Q3TMP1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms