Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR2

Xlr4c, X-linked lymphocyte-regulated 4C, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4cQ3TKR2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xlr4cQ3TKR2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms