Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp39Q3TIX9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms