Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms