Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms