Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml4Q3LRV9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml4Q3LRV9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms