Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Shroom4Q1W617 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Shroom4Q1W617 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Shroom4Q1W617 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Shroom4Q1W617 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
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