Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ptchd1Q14B62 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ptchd1Q14B62 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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