Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spatc1Q148B6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spatc1Q148B6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spatc1Q148B6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spatc1Q148B6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spatc1Q148B6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spatc1Q148B6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spatc1Q148B6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spatc1Q148B6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spatc1Q148B6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spatc1Q148B6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spatc1Q148B6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spatc1Q148B6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spatc1Q148B6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spatc1Q148B6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spatc1Q148B6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Spatc1Q148B6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Spatc1Q148B6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Spatc1Q148B6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spatc1Q148B6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spatc1Q148B6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spatc1Q148B6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spatc1Q148B6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Spatc1Q148B6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Spatc1Q148B6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Spatc1Q148B6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spatc1Q148B6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spatc1Q148B6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spatc1Q148B6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spatc1Q148B6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spatc1Q148B6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spatc1Q148B6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spatc1Q148B6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spatc1Q148B6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spatc1Q148B6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spatc1Q148B6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spatc1Q148B6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spatc1Q148B6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spatc1Q148B6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spatc1Q148B6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spatc1Q148B6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spatc1Q148B6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spatc1Q148B6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms