Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gli2Q0VGT2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gli2Q0VGT2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms