Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cntnap5bQ0V8T8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntnap5bQ0V8T8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.3 ms