Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Neurl1bQ0MW30 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms