Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc4Q08624 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms