Protein–RNA interactions for Protein: Q08553

SYC1, Protein SYC1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYC1Q08553 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.33□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 Q0017Q0017 162 nt0.33□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 PET111YMR257C 2403 nt0.33□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 FMP27YLR454W 7887 nt0.32□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 YER079WYER079W 633 nt0.32□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 YJL120WYJL120W 324 nt0.32□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 RPS25BYLR333C 327 nt0.32□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 YBR285WYBR285W 435 nt0.32□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 SEC8YPR055W 3198 nt0.31□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.31□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.31□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 YAR029WYAR029W 225 nt0.31□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 YMR321CYMR321C 318 nt0.31□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 PRP5YBR237W 2550 nt0.31□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.31□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 YJR157WYJR157W 363 nt0.3□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 ABF2YMR072W 552 nt0.3□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.29□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 OST4YDL232W 111 nt0.29□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 ULP2YIL031W 3105 nt0.29□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.28□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 VIK1YPL253C 1944 nt0.27□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 AGA2YGL032C 264 nt0.27□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.27□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.27□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 YNL324WYNL324W 396 nt0.27□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 YOR121CYOR121C 306 nt0.27□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 PRP42YDR235W 1635 nt0.27□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 YHR138CYHR138C 345 nt0.26□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 HAL9YOL089C 3093 nt0.26□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.25□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 snR190snR190 190 nt0.25□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 RPL35AYDL191W 363 nt0.24□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 BEM3YPL115C 3387 nt0.23□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.23□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.23□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 YAR053WYAR053W 297 nt0.23□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt0.23□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 HTB2YBL002W 396 nt0.23□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 YOR345CYOR345C 351 nt0.23□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 TRS65YGR166W 1683 nt0.23□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 SSS1YDR086C 243 nt0.22□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.22□□□□□ -2.37
SYC1Q08553 AI1Q0050 2505 nt0.21□□□□□ -2.38
SYC1Q08553 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.21□□□□□ -2.38
SYC1Q08553 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.21□□□□□ -2.38
SYC1Q08553 LEE1YPL054W 906 nt0.21□□□□□ -2.38
SYC1Q08553 BIR1YJR089W 2865 nt0.2□□□□□ -2.38
SYC1Q08553 MLP1YKR095W 5628 nt0.19□□□□□ -2.38
SYC1Q08553 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.19□□□□□ -2.38
SYC1Q08553 YOL014WYOL014W 375 nt0.19□□□□□ -2.38
SYC1Q08553 ESP1YGR098C 4893 nt0.19□□□□□ -2.38
SYC1Q08553 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.18□□□□□ -2.38
SYC1Q08553 ORC3YLL004W 1851 nt0.18□□□□□ -2.38
SYC1Q08553 MYO1YHR023W 5787 nt0.17□□□□□ -2.38
SYC1Q08553 STE5YDR103W 2754 nt0.17□□□□□ -2.38
SYC1Q08553 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.17□□□□□ -2.38
SYC1Q08553 COG8YML071C 1824 nt0.17□□□□□ -2.38
SYC1Q08553 RPS26AYGL189C 360 nt0.16□□□□□ -2.38
SYC1Q08553 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.16□□□□□ -2.38
SYC1Q08553 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.16□□□□□ -2.38
SYC1Q08553 NNF2YGR089W 2811 nt0.15□□□□□ -2.38
SYC1Q08553 YDR048CYDR048C 315 nt0.15□□□□□ -2.39
SYC1Q08553 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.15□□□□□ -2.39
SYC1Q08553 IQG1YPL242C 4488 nt0.14□□□□□ -2.39
SYC1Q08553 ULI1YFR026C 510 nt0.14□□□□□ -2.39
SYC1Q08553 QCR9YGR183C 201 nt0.14□□□□□ -2.39
SYC1Q08553 YPR092WYPR092W 306 nt0.14□□□□□ -2.39
SYC1Q08553 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.13□□□□□ -2.39
SYC1Q08553 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.13□□□□□ -2.39
SYC1Q08553 YKL136WYKL136W 399 nt0.13□□□□□ -2.39
SYC1Q08553 YLR282CYLR282C 342 nt0.13□□□□□ -2.39
SYC1Q08553 BIL1YOR304C-A 231 nt0.13□□□□□ -2.39
SYC1Q08553 YNL146WYNL146W 303 nt0.12□□□□□ -2.39
SYC1Q08553 RCO1YMR075W 2055 nt0.12□□□□□ -2.39
SYC1Q08553 COY1YKL179C 2040 nt0.11□□□□□ -2.39
SYC1Q08553 RPS27BYHR021C 249 nt0.11□□□□□ -2.39
SYC1Q08553 YCR022CYCR022C 345 nt0.1□□□□□ -2.39
SYC1Q08553 YGR035CYGR035C 351 nt0.09□□□□□ -2.4
SYC1Q08553 NIP1YMR309C 2439 nt0.08□□□□□ -2.4
SYC1Q08553 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.08□□□□□ -2.4
SYC1Q08553 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.08□□□□□ -2.4
SYC1Q08553 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt0.07□□□□□ -2.4
SYC1Q08553 CSE2YNR010W 450 nt0.07□□□□□ -2.4
SYC1Q08553 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt0.06□□□□□ -2.4
SYC1Q08553 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.05□□□□□ -2.4
SYC1Q08553 THO2YNL139C 4794 nt0.05□□□□□ -2.4
SYC1Q08553 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.04□□□□□ -2.4
SYC1Q08553 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.04□□□□□ -2.4
SYC1Q08553 COX12YLR038C 252 nt0.04□□□□□ -2.4
SYC1Q08553 MLP2YIL149C 5040 nt0.04□□□□□ -2.4
SYC1Q08553 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.03□□□□□ -2.4
SYC1Q08553 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.03□□□□□ -2.4
SYC1Q08553 snR60snR60 104 nt0.02□□□□□ -2.41
SYC1Q08553 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.02□□□□□ -2.41
SYC1Q08553 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.02□□□□□ -2.41
SYC1Q08553 BUL2YML111W 2763 nt0.02□□□□□ -2.41
SYC1Q08553 BLI1YKL061W 342 nt0□□□□□ -2.41
SYC1Q08553 YLR041WYLR041W 321 nt0□□□□□ -2.41
SYC1Q08553 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36 ms