Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atf4Q06507 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf4Q06507 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms