Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mex3cQ05A36 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mex3cQ05A36 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms