Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rcn1Q05186 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms