Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc2Q05020 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apoc2Q05020 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apoc2Q05020 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc2Q05020 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc2Q05020 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc2Q05020 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc2Q05020 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms