Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Emx2Q04744 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms