Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CkbQ04447 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CkbQ04447 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CkbQ04447 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms