Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kcnb1Q03717 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcnb1Q03717 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms