Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms