Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msx2Q03358 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms