Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GscQ02591 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GscQ02591 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GscQ02591 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GscQ02591 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GscQ02591 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GscQ02591 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GscQ02591 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GscQ02591 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GscQ02591 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GscQ02591 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GscQ02591 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GscQ02591 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GscQ02591 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GscQ02591 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GscQ02591 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GscQ02591 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GscQ02591 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GscQ02591 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GscQ02591 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GscQ02591 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GscQ02591 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GscQ02591 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GscQ02591 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GscQ02591 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GscQ02591 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GscQ02591 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GscQ02591 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GscQ02591 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GscQ02591 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GscQ02591 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GscQ02591 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GscQ02591 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GscQ02591 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GscQ02591 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GscQ02591 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GscQ02591 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GscQ02591 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GscQ02591 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GscQ02591 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GscQ02591 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GscQ02591 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GscQ02591 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GscQ02591 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GscQ02591 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GscQ02591 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GscQ02591 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GscQ02591 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GscQ02591 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GscQ02591 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GscQ02591 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GscQ02591 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GscQ02591 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GscQ02591 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GscQ02591 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GscQ02591 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GscQ02591 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GscQ02591 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GscQ02591 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GscQ02591 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GscQ02591 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GscQ02591 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GscQ02591 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GscQ02591 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GscQ02591 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GscQ02591 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GscQ02591 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GscQ02591 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GscQ02591 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GscQ02591 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GscQ02591 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GscQ02591 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GscQ02591 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GscQ02591 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GscQ02591 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GscQ02591 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GscQ02591 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GscQ02591 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GscQ02591 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GscQ02591 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GscQ02591 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GscQ02591 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GscQ02591 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GscQ02591 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GscQ02591 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GscQ02591 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GscQ02591 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GscQ02591 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GscQ02591 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GscQ02591 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GscQ02591 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GscQ02591 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GscQ02591 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GscQ02591 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GscQ02591 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GscQ02591 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GscQ02591 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GscQ02591 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GscQ02591 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GscQ02591 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms