Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnb1Q02248 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnb1Q02248 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms