Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snai1Q02085 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snai1Q02085 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms